锆不易腐蚀，主要在核子反应堆用作燃料棒的护套材料，以及用作抗腐蚀的合金。由于锆的中子截面积非常小，中子几乎可以完全透过锆，因此锆合金在核裂变反应堆中可以作为核燃料的包覆管结构材料，如锆2和锆4合金。唯一的坏处是到摄氏1260度以上时会跟水蒸汽反应产生氢气，造成氢爆。
锆也用在X光衍射仪器，当使用的为钼靶时，则利用锆以过滤其他不需要的频率。
在有机化学，锆是过渡金属参与的有机合成方法学研究中比较新颖的一种金属，锆可以和碳形成五元环或者六元环，然后被其他基团进攻而离去，从而构筑有机物的骨架。利用锆化学的方法可以合成很多新奇的化合物，比如中国科学院上海有机所刘元红研究组曾经通过锆化学的方法合成和分离出连五烯结构的化合物立方氧化锆莫氏硬度可达8.5。
锆合金常用于金属之切割，白色的二氧化锆为陶瓷刀的主要成分，非常硬，但不耐摔，一摔即碎。
